Química Orgânica 2 · Aminoácidos e conectividade dos peptídeos
Modelo de acil-enzima Ac-Lys-OMe a partir de Ac-Lys-NHMe (tripsina)
Condições: imidazole (His-57 model), oxyanion-hole H-bond donors; CH3OH models Ser-195
Desenhe este problema você mesmo
Arraste dos elétrons que se movem até onde eles vão, ou toque em um e depois no outro. Cada seta é verificada; Dica ajuda quando você travar. Não precisa de conta.
O mecanismo, passo a passo
Próximo mostra as setas curvas de cada passo e as explica. Os passos escritos estão abaixo.
Ler todos os 4 passos escritos
O oxigênio que imita a serina ataca, com o imidazol como base
Na tripsina, a cadeia lateral positiva da lisina se aloja no bolsão S1, ao lado da Asp-189, o que posiciona a carbonila da amida após a lisina junto à Ser-195. Aqui, o metanol faz o papel da serina e o imidazol, o da His-57: enquanto o oxigênio do metanol se adiciona à carbonila da amida, o imidazol remove seu próton O–H, e o par π da C=O vai para o oxigênio.
As setas curvas
- O par isolado do oxigênio do metanol ataca o carbono carbonílico da amida.
- O par π da C=O vai para o oxigênio, formando o oxiânion.
- O par isolado do nitrogênio do imidazol captura o próton O–H enquanto o oxigênio se liga.
- O par da ligação O–H permanece no oxigênio do metanol, que mantém sua nova ligação com o carbono.
O oxiânion colapsa e a amina sai
O oxiânion, estabilizado na enzima por ligações de hidrogênio N–H do bolsão do oxiânion, refaz a ligação C=O. A ligação C–N se rompe, e o nitrogênio que sai captura, na mesma etapa, o próton do imidazólio, de modo que deixa a molécula como metilamina neutra, nunca como íon amideto.
As setas curvas
- O par isolado do oxiânion refaz a ligação π C=O.
- A ligação C–N se rompe e seus elétrons vão para o nitrogênio.
- O par isolado do nitrogênio captura o próton do imidazólio.
- O par da ligação N–H permanece no nitrogênio, regenerando o imidazol.
Por que a tripsina corta após a lisina
A especificidade vem do bolsão S1.
Ac-Lys-OMe (modelo de acil-enzima)
O éster Ac-Lys-OMe modela a acil-enzima, com o primeiro produto, a metilamina, liberado e o imidazol regenerado. Na tripsina, a água ataca depois a acil-enzima pelas mesmas duas etapas, liberando o ácido carboxílico e a Ser-195.
O que você vai praticar
Desenhe a adição, catalisada por base geral, de um metanol que imita a serina à carbonila da amida da lisina e a perda de metilamina assistida por ácido geral, que modelam a etapa de acil-enzima da tripsina.
Você acabou de desenhar cada seta deste problema.
Cada um dos 5349 problemas de Orgânica 1 e 2 funciona assim: feedback em cada seta, dicas quando você travar e um modo prova sem dicas. Grátis com uma conta, sem cartão.
Travou na sua própria lição?
Tire uma foto: o primeiro scan é grátis, sem cadastro
Você escaneia toda semana? Scan Standard: por cerca de problemas