Química Orgânica 2 · Aminoácidos e conectividade dos peptídeos
PTC-Ala-Gly a partir de Ala-Gly e isotiocianato de fenila
Condições: PhNCS, pyridine/H2O, pH 9
Desenhe este problema você mesmo
Arraste dos elétrons que se movem até onde eles vão, ou toque em um e depois no outro. Cada seta é verificada; Dica ajuda quando você travar. Não precisa de conta.
O mecanismo, passo a passo
Próximo mostra as setas curvas de cada passo e as explica. Os passos escritos estão abaixo.
Ler todos os 5 passos escritos
A amina N-terminal se adiciona ao PhNCS
Em pH 9, o grupo amino N-terminal de Ala-Gly está majoritariamente desprotonado, então seu par isolado fica livre para atacar. Ele se adiciona ao carbono central do isotiocianato de fenila, o carbono eletrofílico entre o nitrogênio e o enxofre, e o par π da C=N vai para o nitrogênio do anilídeo.
As setas curvas
- O par isolado da amina ataca o carbono central do isotiocianato.
- O par π da C=N vai para o nitrogênio arílico, que se torna um ânion.
A piridina remove o próton N–H
O aduto é um zwitterion. A piridina captura o próton do nitrogênio da alanina, carregado positivamente; essa é a primeira metade de uma transferência de próton intermediada entre os dois nitrogênios.
As setas curvas
- O par isolado do nitrogênio da piridina captura o próton N–H.
- O par da ligação N–H volta para o nitrogênio da alanina.
O piridínio protona o nitrogênio do anilídeo
Agora o íon piridínio cede seu próton ao nitrogênio arílico carregado negativamente, completando a tioureia. A piridina é regenerada, portanto apenas transporta prótons.
As setas curvas
- O par isolado do nitrogênio arílico captura o próton do piridínio.
- O par da ligação N–H permanece no nitrogênio, regenerando a piridina.
Por que pH 9
A amina precisa estar livre.
PTC-Ala-Gly
Forma-se o peptídeo feniltiocarbamoílico PTC-Ala-Gly e a piridina é regenerada. Só o resíduo N-terminal carrega a tioureia, então a etapa ácida posterior remove apenas a alanina e deixa a glicina para o próximo ciclo.
O que você vai praticar
Desenhe a adição da amina N-terminal de Ala-Gly ao isotiocianato de fenila e a transferência de próton intermediada pela piridina que gera o peptídeo feniltiocarbamoílico.
Você acabou de desenhar cada seta deste problema.
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